كتاب القائد إلى تصحيح العقائد: يعد هذا الكتاب من أجود ما كتب في بابه في مناقشة المتكلمين والمتفلسفة الذين انحرفوا بتطرفهم وتعمقهم في النظر والأقيسة والمباحث، حتى خرجوا عن صراط المستقيم الذي سار عليه الذي أنعم الله عليهم من النبيين والصديقين والشهداء والصالحين من إثبات صفات الله تعالى، وقد حقق الكتاب الشيخ العلامة الألباني.
الأنوار الكاشفة : كتاب للعلامة المعلمي اليماني - رحمه الله - نقض فيه كتاب «أضواء على السنة المحمدية» لمحمود أبو رية؛ والذي وجه فيه جملة من الطعون والشبهات إلى السنة النبوية والعمل بها.
مجموعٌ يشتمل على عشر رسائل في العقيدة، للعلَّامة المعلمي اليماني - رحمه الله -، وأسماؤها: حقيقة التَّأويل، حقيقة البِدْعة، صَدْع الدُّجُنَّة في فَصْل البِدعة عن السُّنَّة، الحنيفيَّة والعَرَب، عقيدة العَرَب في وثنيَّتهم، الرد على حسن الضالعي، ما وَقَع لبعض المسلمين من الرِّياضة الصُّوفية والغُلُوِّ فيها، رسالة في الشفاعة، التفضيل بين الخلفاء الأربعة رضي الله عنهم، تعلّق العقائد بالزمان والمكان.
مجموعة رسائل في التفسير للعلامة المعلمي اليماني - رحمه الله -، وهي رسائل متنوعة في موضوعاتها، فرسالة في تفسير البسملة، وأخرى في تفسير سورة الفاتحة، ورسالة في بيان تناسب الآيات وارتباطها في سورة البقرة، وثلاث رسائل في تفسير آيات مشكلة، وثلاث أخرى في الإعراب، ورسالة في تفسير لغوي، وغيرها.
رسالة العبادة : كتاب للعلامة المعلمي اليماني، استقرأ فيه الآيات القرآنية ودلائل السنة والسيرة وغيرها؛ لتحقيق ما هي العبادة، ثم تحقيق ما هو عبادة الله - عز وجل - مما هو عبادة لغيره.
مجموع رسائل الفقه : مجموع يضم عدة رسائل فقهية، للعلامة المعلمي اليماني - رحمه الله -، وهي 38 رسالة متفاوتة الحجم، بعضها تامة حررها المؤلف، وأخرى ناقصة لم يُكمِلها.
مجموع الرسائل الحديثية : مجموع يضم عدة رسائل في علوم الحديث وما يتعلّق به، للعلامة المعلمي اليماني - رحمه الله -، وقد كتبها في فترات مختلفة، فبعضها إبّان إقامته في الهند، وبعضها إبَّان استقراره في مكة المكرمة.
مجموع رسائل في التحقيق وتصحيح النصوص : كتاب للعلامة المعلمي؛ يشتمل على ثلاث رسائل في أصول التحقيق، ورسالة فيها تخريج الأحاديث الواردة في كتاب «شواهد التوضيح» لابن مالك، ورسالة فيها تصحيحات وتعليقات على كتاب «سبل السلام» للصنعاني، ورسالتين في التنبيه على أخطاء وأوهام في «الكامل» للمبرد، و «معجم الأدباء» لياقوت.
فوائد المجاميع : سِفْر نفيس منتخب من مجاميع العلامة المعلمي - رحمه الله - يشتمل على فوائد نفيسة، وتقييدات محرّرة، واستدراكات دقيقة، وبحوث مبسوطة حينًا ومختصرة حينًا، وأشعارٍ ورُؤًى قيَّدها الشيخ في أوقات مختلفة.
كتاب منتخبٌ في تراجم رواة الحديث للعلامة المعلمي، انتخب تراجمه من كتابين يُعدّان من أشهر كتب الرجال، وهما «ميزان الاعتدال» للحافظ الذهبي، و«تهذيب التهذيب» للحافظ ابن حجر.
كتاب الوحدان : كتاب جديد على نحو مبتكر؛ للعلامة المعلمي اليماني - رحمه الله - جمع فيه الرواة الذين ليس لهم إلا راو واحد؛ مع بيان أحوالهم من حيث الثقة والضعف، والقبول والرد.
التنكيل بما في تأنيب الكوثري من الأباطيل : كتاب نفيس للعلامة المعلمي اليماني - رحمه الله - جمع بين دفتيه بيان منهج أهل الحديث في تقرير العقيدة، وبحث المسائل الفقهية، وتحرير قواعد الجرح والتعديل، ورد المطاعن عن أئمة السنة وثقات رواتها.
مجموع يضم بين دفتيه ثلاثة كتب من تأليف العلامة المعلمي اليماني - رحمه الله -، يربطها ببعضها رابط وثيق، ولكل منها دور في تكميل الآخر وتعزيزه، والثلاثة جميعًا تعتبر كالتوطئة للكتاب العظيم «التنكيل بما في تأنيب الكوثري من الأباطيل».